Ama Adli Tıp tam tersini söylüyordu. Ergin Saygun'a sağlam raporu verildi. Mahkemenin kararında bu rapor etkili oldu. Adli Tıp'ın GATA'yı yalanlaması gözleri GATA'ya çevirdi. Sadece Saygun değil diğer bazı Balyoz ve Ergenekon sanıkları da GATA'da yattı. İddialara göre işlerini ayarlamak için GATA'yı bir durak olarak kullandılar. Onlardan biri de İkinci Ergenekon davası sanığı Şener Eruygur'du. GATA'ya göre hasta yatağında olması gereken Eruygur, Kadıköy'de bir cafede görüntüleniyordu. Mahkeme bu görüntünün peşini bırakmadı. Eruygur'u Adli Tıp'a gönderdi. Adli Tıp da Eruygur'un sağlıklı olduğuna dair rapor hazırladı. Şimdi o rapor 13. Ağır Ceza Mahkemesi'nde. Mahkemenin rapor doğrultusunda bir karar vermesi bekleniyor. Bazı sanıkların GATA'yı yargıdan kaçış tüneli olarak kullandığı da öne sürülüyor. İnternet Andıcı davası sanığı Tümgeneral Mustafa Bakıcı'nın firarı bu iddiayı doğruluyor. Hakkında yakalama kararı çıkan Bakıcı GATA'ya gitti. Taburcu edilir edilmez de sırra kadem bastı. İddia o ki firar planını GATA'dayken hazırladı. Ergenekon Sanığı Levent Ersöz de GATA'da yatanlardan. Ersöz neredeyse cezaevinde yatmadı. Hastane hastane dolaştı. İki kez de GATA'da tedavi gördü. Adli Tıp 2011'de Ersöz için de sağlıklıdır raporu vermişti. İnternet Andıcı sanığı orgeneral Nusret Taşdeler de iddiaya göre GATA'da kalıyor. Taşdeler'e hasta değil kral muamelesi yapıldığı öne sürülüyor. Taşdeler'in yedinci katta lüks bir odada misafir edildiği iddialar arasında. Doktorlar'ın yönetimden korktuğu için Taşdeler'i taburcu edemediği konuşuluyor Emekli Orgeneral Çetin Doğan, Yurdaer Olcan, Abdullah Dalay, Abdullah Gavremoğlu, Engin Alan ve Süha Tanyeri gibi Balyoz sanıkları da bir süre GATA'da yatmıştı.