Özel yetkili mahkemelerin yetkilerinin ve kaldırılmalarının tartışıldığı sırada açıklanan kararname iki yönüyle dikkat çekti. Birincisi KCK soruşturma ve davalarının görüldüğü Diyarbakır'da önemli değişiklikler oldu. İkincisi de İstanbul Özel Yetkili Başsavcı Vekilliğinde görev yapan Cumhuriyet Savcısı Mehmet Berk ve Cihan Kansız gibi isimlerin, özel yetkilerinin kaldırılarak 'Başsavcı Vekilliği' formülü ile görev yerleri değiştirildi. İstanbul özel yetkili savcılık ve mahkemelerinde görevliyken görev yerleri değiştirilen hâkim ve savcıların isimleri ve kararnamenin bu isimler açısından önemi şöyle: Şike soruşturmasında, Fenerbahçe Başkanı Aziz Yıldırım ile 92 kişi hakkında dava açan Cumhuriyet Savcısı Mehmet Berk'in özel yetkisi kaldırılarak Küçükçekmece Başsavcı Vekilliği görevine atandı. Ergenekon soruşturmasının Özel Yetkili Savcısı Cihan Kansız, İstanbul Başsavcı Vekilliği'ne getirildi. Balyoz davasının Özel Yetkili Savcısı Savaş Kırbaş, İstanbul Anadolu Cumhuriyet Başsavcı Vekilliği'ne atandı. Hrant Dink cinayeti davasının görüldüğü Özel Yetkili 14. İstanbul Ağır Ceza Mahkemesi Başkanı Rüstem Eryılmaz, Bakırköy Ağır Ceza Mahkemesi Başkanlığı'na atandı. Daha önce Ergenekon soruşturmalarında verdiği tahliye kararları ile dikkat çeken ve bu nedenle Eskişehir'e atanan Oktay Kuban yeniden İstanbul hâkimi oldu. Uludere soruşturmasını yürüten Diyarbakır Özel Yetkili Başsavcı Vekili Ahmet Karaca, Adana Başsavcı Vekilliği'ne atandı. Uludere olayının ilk aşamasını soruşturan Uludere Savcıları Ahmet Sakman ile Ali Türk İnegöl ve Karaman savcılıklarına getirildi. Sakman ve Türk, Genelkurmay Başkanlığı'ndan ilk heron görüntülerini isteyen ve olay yerinde keşif yapan isimlerdi.