17 Nisan 2009'da tutuklandı. Metris Cezaevi'ne kondu. Bir kaç saat geçmişti ki, göğüs ağrısı şikayetiyle hastaneye kaldırıldı. Ve bir daha cezaevine geri dönmedi. TEDAVİYİ REDDETTİ İDDİASI Başkent Üniversitesi eski rektörü Mehmet Haberal o gün bugündür İstanbul Üniversitesi Kardioloji Enstitüsünde tutuluyor. Doktorlar ilk olarak, kalp ritim bozukluluğu tanısı konulan Haberal'a basit bir tedavi olan elektrofizyolojik tedaviyi önerdi. Haberal'ın, bu tedaviyi reddettiği ve hastanede yatmaya devam ettiği öne sürüldü. İLK "TABURCU OLABİLİR" RAPORU 28 EYLÜL'DE VERİLMİŞ Ergenekon sanığına ilk "taburcu olabilir" raporunun, 28 Eylül 2009 günü verildiği ortaya çıktı. Ancak Haberal, yine taburcu olmadı. Konuyu takip eden basın mensupları, korumalarının saldırısına uğruyordu. "Haberal'ın özel korumalarının tavırları sebebiyle doktorların, ETÖ iddiaları sanığıyla ilgili sağlıklı karar vermeye çekindiği" en çok konuşulan iddialar arasında. "AYAKTA TEDAVİ EDİLEBİLİR" Son olarak, Enstitüsü Başkanı'nın talimatıyla 5 kişilik bir heyet oluşturuldu. Haberal'la ilgili bir rapor hazırlandı. Dört profesör ve bir doçentten oluşan heyet, altı aydır hastanede yatan Haberal'a "Ayakta tedavi edilebilir. Taburcu edilsin" raporu verdi. HABERAL'A SAĞLAM RAPORU "5 kişilik kurul tarafından enstitümüzün 3. servisinde 304 numaralı odada yatmakta olan Mehmet Haberal'ın durumu değerlendirilmiş ve tıbbi tedavisine ayakta devam edilerek bir ay sonra kontrole gelmek üzere taburcu edilmesine karar verilmiştir." "SAĞLAM" RAPORUNUN ÜZERİNDEN 14 GÜN GEÇTİ 16 Ekim'de yani 14 gün önce verildiği öne sürülen bu rapora rağmen Haberal'ın hastane günleri yine son bulmadı. Bu durum Ergenekon Davası'na bakan mahkemeyi de harekete geçirmişti. İstanbul 13. Ağır Ceza Mahkemesi, Başkent Üniversitesi eski Rektörü Mehmet Haberal'ın "sağlık" durumlarını gösteren raporların, "ilgili kurumlardan" istenmesine karar vermişti. Kamuoyu, şimdi bu raporların bir an önce mahkemeye ulaşmasını bekliyor.