Özel yetkili İstanbul Cumhuriyet Savcısı Hüseyin Aksoy tarafından hazırlanan ve 2 sayfadan oluşan iddianamede tek şüpheli olarak Emrah Kaplan bulunuyor. İddianamede, Emrah Kaplan hakkında ''terör örgütüne üye olmak'' suçundan 5 yıldan 10 yıla kadar hapsi istendi. İddianamenin tamamlanarak İstanbul Cumhuriyet Başsavcıvekili Fikret Seçen'e gönderildiği öğrenildi. İzmit-Karamürsel arasında sefer yapan 'Kartepe' deniz otobüsü 11 Kasım 2011 tarihinde kaçırılmıştı. Üzerinde kabloların yer aldığı bir düzenek bulunan ve adının Mensur Güzel olduğu öğrenilen terörist, deniz otobüsünü Silivri açıklarına getirtmişti. Gemiye çıkan güvenlik güçleri teröristi etkisiz hale getirirken feribottaki 18 yolcu ve 5 mürettebat sağ kurtarılmıştı. Teröristin üzerinden ise Emrah Kaplan kimliği çıkmıştı. Ancak operasyonda ölü ele geçirilen teröristin gerçek adının Mensur Güzel olduğunu açıklanmıştı. Mensur Güzel'in üzerinde bulunan kimliğin sahibi Emrah Kaplan ise, 13 Kasım 2011'de Diyarbakır'ın Çınar ilçesine bağlı Solmaz köyünde yakalandı. Soruşturmanın yapıldığı İstanbul'a gönderilen Kaplan çıkarıldığı mahkeme tarafından tutuklanarak cezaevine gönderilmişti.